1、類別不同：黑棗屬于柿子，紅棗屬于紅棗。

2、主要功效不同：黑棗的主要功效是滋補脾胃，而紅棗的主要功效是補血入藥。紅棗能滋養血管，人們認為是一種很好的補品。可以治療面容憔悴、肌肉萎縮、血液異常等疾病雖然黑棗不像紅棗那樣被廣泛用作藥物，但通常有助于補腎和胃。

3、營養價值不同：紅棗富含膳食纖維和果膠，有助于消化和排便。紅棗富含維生素A、維生素C、維生素B2等。

黑棗雖然也叫棗，但其實不屬于我們通常認識的棗類，一般指君遷子，柿科落葉喬木。高可達30米，胸高直徑可達1.3米，樹冠近球形或扁球形，樹皮灰黑色或灰褐色。果近球形或橢圓形，初熟時為淡黃色，后則變為藍黑色，常被有白色薄蠟層。

成熟果實可供食用，亦可制成柿餅，入藥可止消渴、去煩熱。又可供制糖、釀酒、制醋。未熟果實可提制柿漆，供醫藥和涂料用。木材可作紡織木梭、雕刻、小用具等，可作精美家具和文具。樹皮可供提取單寧和制人造棉。